As Faculdades são Unidades Universitárias de Administração e coordenação das atividades de ensino, pesquisa e extensão, que desempenham, através de seus órgãos, funções deliberativas e executivas.
Os órgãos da estrutura organizacional de cada Faculdade são os seguintes:
1. Conselho Acadêmico-Administrativo-CONSAD;
2. Diretoria;
3. Orientação de Cursos de Graduação;
4. Secretaria Administrativa;
5. Plenárias de Departamentos;
6. Departamentos Acadêmicos;
7. Seção de Expediente;
8. Núcleos Acadêmicos de Pesquisa e Extensão.
A Universidade é constituída pelas seguintes Faculdades e respectivos Departamentos a elas subordinados:
1. Faculdade de Ciências Econômicas-FACEM
1.1 Departamento de Economia
1.2 Departamento de Administração
1.3 Departamento de Ciências Contábeis
1.4 Departamento de Turismo
1.5 Departamento de Gestão Ambiental
2. Faculdade de Serviço Social-FASSO
2.1 Departamento de Serviço Social
3. Faculdade de Educação-FE
3.1 Departamento de Educação
4. Faculdade de Letras e Artes-FALA
4.1 Departamento de Letras Vernáculas
4.2 Departamento de Letras Estrangeiras
4.3 Departamento de Artes
6. Faculdade de Educação Física-FAEF
6.1 Departamento de Educação Física
7. Faculdade de Filosofia e Ciências Sociais-FAFIC
7.1 Departamento de Ciências Sociais e Políticas
7.2 Departamento de Filosofia
7.3 Departamento de Geografia
7.4 Departamento de História
7.5 Departamento de Comunicação Social
8. Faculdade de Ciências Exatas e Naturais-FANAT
8.1 Departamento de Matemática e Estatística
8.2 Departamento de Física
8.3 Departamento de Ciências Biológicas
8.4 Departamento de Química
8.5 Departamento de Informática
9. Faculdade de Direito-FAD
9.1 Departamento de Direito
10. Faculdade de Ciências da Saúde-FACS
10.1 Departamento de Ciências Biomédicas
11. Faculdade de Enfermagem-FAEN
11.1 Departamento de Enfermagem
